Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACACAQ13085 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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