Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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