Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMAN2Q12907 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms