Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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