Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
STX4Q12846 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
STX4Q12846 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
STX4Q12846 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms