Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms