Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYP4F3Q08477 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms