Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms