Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIBQ01892 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms