Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXK2Q01167 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXK2Q01167 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms