Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms