Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP107P57740 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms