Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCBP3P57721 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP3P57721 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms