Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BACE1P56817 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BACE1P56817 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BACE1P56817 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms