Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1EP49674 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms