Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUFMP49411 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUFMP49411 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUFMP49411 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms