Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNTBP49356 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTBP49356 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTBP49356 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms