Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRXP46100 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRXP46100 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRXP46100 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRXP46100 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRXP46100 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRXP46100 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRXP46100 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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