Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP3P42574 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP3P42574 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP3P42574 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms