Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZEB1P37275 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms