Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP214P35658 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP214P35658 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms