Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPB2P35606 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPB2P35606 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
COPB2P35606 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
COPB2P35606 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPB2P35606 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPB2P35606 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPB2P35606 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPB2P35606 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPB2P35606 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPB2P35606 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPB2P35606 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPB2P35606 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms