Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms