Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA7P31268 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA7P31268 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms