Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK6P29122 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms