Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNA2P26232 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms