Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NFKBIAP25963 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms