Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTSSP25774 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CTSSP25774 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSSP25774 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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