Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms