Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRHP20396 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRHP20396 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRHP20396 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms