Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPN1P18031 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms