Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB4P17483 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms