Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms