Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GP1BBP13224 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms