Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2AF1L5P0DN76 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms