Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2BP0DI82 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC2BP0DI82 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms