Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX7O95931 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms