Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DENRO43583 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DENRO43583 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DENRO43583 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DENRO43583 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DENRO43583 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DENRO43583 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms