Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF14O43557 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms