Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4E171 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4E171 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4E171 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4E171 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4E171 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms