Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HACD1B0YJ81 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms