Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
XIRP2A4UGR9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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