Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT52Q9Y366 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT52Q9Y366 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT52Q9Y366 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms