Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MED16Q9Y2X0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED16Q9Y2X0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED16Q9Y2X0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED16Q9Y2X0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms