Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BTRCQ9Y297 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BTRCQ9Y297 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BTRCQ9Y297 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms