Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VDAC3Q9Y277 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VDAC3Q9Y277 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms