Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS4AQ9UN37 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS4AQ9UN37 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS4AQ9UN37 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms