Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NLKQ9UBE8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NLKQ9UBE8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NLKQ9UBE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms