Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM53CQ9NYF3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM53CQ9NYF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM53CQ9NYF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms