Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB4Q9NTQ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJB4Q9NTQ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB4Q9NTQ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms